В третата част от известната сага Нина Каленков е на път да се омъжи за Макс Грубер, но екип на спецчастите прониква в апартамента им ден преди свадбата и отвлича Макс. Властите казват, че не знаят нищо за подобна операция. Кой тогава е отговорен за това?
По време на разследванията си, Нина среща на няколко пъти числото Пи, за да открие древна тайна, която я отвежда от Архимед през Леонардо да Винчи до днешни дни в лабораторията за ядрени изследвания в Швейцария. Това ли е мястото, където е Макс? И дали след разкриването на тайната и решаването на множеството пъзели в тази игра Нина и Макс ще са в състояние да живеят щастливо за в бъдеще.
Запазвайки традицията, Secret Files 3 тъче убедително мистерията около реални явления, като за този епизод създателите са работили с три филмови писатели, които са допринесли за историята и диалозите още по-интензивно.